李世民发动的玄武门之变，给后世留下的太多的疑团。究其原因，就在于李世民成功后，曾对这段历史进行过一定的修理。当然“为尊者讳”是必然，无可厚非，皇上大哥也是人，比谁都需要体面。
但同时也不可否认，一旦“修理过度”，就显得心虚，有欲盖弥彰的嫌疑了。而玄武门之变，则显然属于此类。如，明明玄武门之变是发生在晚上，为何李渊却又有那么大的雅致，泛舟湖水之上？还根本不知道玄武门那边，到底发生了啥。
这不是欲盖弥彰是啥？故而主流意见是：玄武门之变发生前后，李渊事实上已经失去了自由，被控制住了。因为当李建成和李世民互殴时，唯有他这老爸皇上能阻止，并起到决定胜负的作用。很不幸，李渊显然是偏袒太子李建成的。
随后便发生了，著名的李世民“跪地吮乳”，父子相拥痛哭流涕的感人场面。许多人都说这是假的，彼此演戏。但笔者却认为这是真的。再怎么说也是父子，两人一直都承受着巨大压力，如今别无选项（胜负已定）后，反而会一身轻，由此变得真情流露。
真以为李渊和李世民，愿意走到这一步，谁也不愿意。否则李世民“欲盖弥彰”干啥？只能说，这就是“江湖”，谁都无法逆转这滔滔的江湖之水。
别以为老大就能为所欲为，什么一声令下，无人不服！其实许多时候，一件事的发生，手下人的集体意志，往往比老大自己的意志还关键。老大若不顺应手下人的集体意志，就会变成孤家寡人，啥也干不成！
显然玄武门之变，就是“秦王势力”和李世民本人意志的合流。手下人纷纷表达干一票后，李世民让长孙无忌，去把房玄龄和杜如晦叫来。哪料却遭拒绝。李世民急眼了，把自己的佩剑交给尉迟恭说：“这次你也跟着去，两人敢不来，就杀了他俩。”
瞅瞅，玄武门之变，可谓里里外外都是戏！李世民手下的重量级人物，除了秦琼外都出现了，那么秦琼呢？
有种说法流传很广，言称：秦琼根本没参加玄武门之变。这就是为何，凌烟阁24功臣，秦琼垫底的原因。但这种说法，是极其不负责任的。
且在《旧唐书》的“秦琼本传”中，也写得很清楚：六月四日，从诛建成、元吉。事宁，拜左武卫大将军，食实封七百户。
显然，秦琼不但参加了玄武门之变，而且事后还被封为“左武卫大将军，食实封七百户”。这个封赏，跟程咬金几乎相同，程咬金是“右武卫大将军，食实封七百户”。
因此从这个角度来言，最多可视为李世民“雪藏”了秦琼罢了。在最关键和重要的战斗中，他选择了尉迟恭。而真正应该探讨是，李世民为何要如此选择呢？在笔者看来，大致有三点原因。
最关键和重要的事，选择最信任的人，这是不变的！
尉迟恭是李世民亲自招降的，从此就成了李世民的心腹爱将。李世民曾公开表示：你尉迟老黑挥槊冲锋，我李二凤持弓箭远程打击，就算面对百万敌军，也不在话下。
秦琼却是阵前反水王世充，跟程咬金一起投奔而来的。且在秦琼归降王世充之前，先是隋朝将领，后成瓦岗山将军。也就是说，有多次转投记录。
而秦琼，据史料推测，他极有可能负责保卫秦王府。也就是说，一旦有人围魏救赵，去攻击李世民的秦王府，那就该秦琼登场了。且，这也差点成为事实。李建成手下大将薛万彻，眼见攻不进玄武门，曾大喊：杀向秦王府，血洗李世民全家。亏得尉迟恭提着李建成首级出现，这才化解。
玄武门之变，连李世民都受到情感影响，最终扑在李渊怀里“跪地吮乳”。所以李世民身边的主要帮手，就不能再受情感左右了。而尉迟恭果然做到了，如杀李元吉，提着李建成首级，喝散太子府兵马，最后恐吓皇上大哥李渊。
这些事秦琼能做出来吗？根本不能。因为秦琼跟李渊，彼此有交情，甚至还是一段传奇佳话。这就是秦琼和尉迟恭的美良川大战。这次大战，秦琼硬碰硬击败了尉迟恭，让岌岌可危的大唐稳住了局面。
意思就是说，你立下这么大的功劳，就算想吃我李渊的肉都没问题，就更不要说我的子女和钱财了！
如此披肝沥胆的话，秦琼能不感动？必然对李渊感恩戴德。因此，他怎么可能做出尉迟恭那样的事？起码恐吓李渊就做不出来——毕竟，有感情交集！
玄武门之变前后，秦琼的身体已经大不如从前了，无法达到“美良川大战”时的神勇无敌，故而不如尉迟恭更胜任！
总之，正因有了这三点，尤其是第二点，秦琼跟李渊有很深的感情交集，就已经注定了他，无法在玄武门之变中，充分发挥作用，故而这才被李世民雪藏。
