生物体是由各种化学物质所构成的，这些化学组成部分在体内不断进行各种化学变化，以维持正常的生命活动，生物化学就是一门研究生物体的化学组成，以及生命过程中发生的各种化学变化规律的科学。生物化学是从分子水平来探讨生命现象的化学本质，所以又被称为生命的化学。
生物化学的发展可以追溯到我国古代，在古时候人们就懂得用曲来发酵酒，这其中就是利用酶来进行发酵，包括各种醋还有酱油等，也都是利用酶发酵的生物过程。我国古代就已经制成豆腐，而豆腐就是利用蛋白质的沉淀性质。唐代药王孙思邈用猪肝治疗雀目，实际是利用富含维生素A的猪肝治疗夜盲症。
18世纪中叶到20世纪初是生物化学的初级阶段，又称静态生物化学阶段，在这个时期主要工作是对生物体的各种组成成分进行分离,纯化，从而确定生物体的化学组成性质及其结构等。在1815年到1832年，法国科学家就鉴定出脂肪，甘氨酸，亮氨酸及纤维素等生物体组成成分。19世纪末，人们又确定了生物体内的单糖，二糖及淀粉等多糖的基本组成和结构。科学家从血液中分离出血红蛋白并于1864年制成结晶，证明血液的红色是由血红蛋白的颜色引起的。
从20世纪初期开始，生物化学进入蓬勃发展的阶段，这个时期重点研究物质的代谢转变。到20世纪50年代基本确定的生物体内主要物质的基本代谢途径，及其能量代谢过程的关系，例如糖酵解过程，三羧酸循环，尿素合成过程，脂肪酸β氧化，ATP生成方式，氧化磷酸化等。在酶学方面制备了胃蛋白酶，胰蛋白酶结晶，证明酶的化学本质是蛋白质。
到20世纪后半叶以来，生物化学飞速发展，进入了分子生物学时期。在1953年首次提出了DNA双螺旋结构模型，标志着生物化学的发展进入了以核酸和蛋白质等生物大分子为主要研究内容的分子生物学时期。此后对DNA的复制，DNA的转录及蛋白质的合成过程进行了深入的研究，提出了遗传信息传递的中心法则。1994年蛋白质组学的概念被提出，蛋白质组学在整体水平上研究组织细胞蛋白质的组成及动态变化，它的发展是人类对生命的认识，又从单个分子的研究回归整体，更有利于揭示生命的奥秘。
生物化学的发展是一个不断前进,不断向前,向更深入发展，从宏观到微观的发展的过程，最后又从单个的研究回归到整体，是一个循环而又联系的过程。
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